Enstitümüz meyve, sebze, süs bitkileri ve bağcılık konusunda yetiştirme teknikleri, ıslah ve genetik ile hastalık ve zararlılar konusunda gerekli araştırma projelerini yürütmek ve sonuçlandırmak suretiyle, yeni çeşitlerin bölge tarımına kazandırılmasını sağlamak, entegre mücadele yöntemleriyle doğal dengeyi korumak, bölgede sorun olan hastalık ve zararlılarla etkin mücadelede bulunmak suretiyle bölge ekonomisine olumlu yönde katkı sağlamak için gerekli çalışmaları yapmaktadır.

Enstitümüzün Zirai Mücadele konusunda bölgesel sorumluluğu bulunmaktadır. Erzincan, Erzurum, Gümüşhane, Bayburt, Kars, Ağrı, Iğdır, Ardahan ve Tunceli illerinde (Harita 1) Hastalık ve Zararlılarla ilgili gerekli çalışmalar yapılmakta İl Müdürlükleri ile gereken temaslar kurulmakta ve Zirai Mücadele konusunda gerek teorik gerekse uygulamalı eğitim seminerleri düzenlenmektedir.

Ayrıca Bahçe Bitkileri Islahı ve Yetiştirme konusunda; Doğu Anadolu Bölgesinde 24 il Erzincan, Erzurum, Gümüşhane, Bayburt, Ağrı, Tunceli, Bingöl, Muş, Bitlis, Van, Hakkari, Siirt (yüksek yerleri) ve Şırnak (yüksek yerleri), Trabzon (iç kesimleri), Giresun (iç kesimleri), Kahramanmaraş (yüksek kesimleri), Adıyaman (yüksek kesimleri), Malatya (yüksek kesimleri), Iğdır ve Artvin (Çoruh Vadisi) Müdürlüğümüzün sorumluluk sahasındadır (Harita 2).

Tokat, Sinop, Samsun, Ordu, Giresun, Trabzon, Rize, Artvin, Amasya, Erzincan, Erzurum, Kars, Ağrı, Iğdır, Ardahan, Gümüşhane ve Bayburt İllerinde kamu ve özel fidancılık tesislerindeki sertifikalı fidan kontrolleri müdürlüğümüzce yapılmaktadır.

Yetiştiricilik konusunda ise Erzincan, Trabzon, Kars, Gümüşhane, Erzurum, Iğdır, Bayburt ve Ardahan illerinin fidan talepleri Müdürlüğümüzce karşılanmaktadır.